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千年蛇妖趁封印变弱逃了出来后被老板所救，机缘巧合下遇见了前往阳界收回冥魂的判官大人崔钰。

明末，人们迷信修仙炼丹拒绝求医，中医式微。少年医者李子明机缘巧合之下从一本破旧的《本草纲目》中召唤出药灵——冬葵仙子。她恳请世间唯一能和曾经的李时珍一样与药灵对话的李子明帮助药灵们收集因事故四散的《本草纲目》残页，拯救草药精灵们的世界，同时将《本草纲目》中记载的资料流传下来，将中医发扬光大。李子明医者仁心，不忍拒绝，从此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不断成长，收集残页的同时也与药灵们结下深厚羁绊。

混混少年秦明，文弱书生白齐，一个是设局人，一个是解局人；一个是阴差阳错，一个是蓄谋已久。二人通过选拔，携手进入金吾卫，虽屡遭到权贵刁难，二人凭借胆识及能力硬是杀出了一条血路。